根據《科技部財政部國家稅務總局關于印發(fā)〈高新技術企業(yè)認定辦法〉的通知》（國辦發(fā)[2008]172號）的規(guī)定，高新技術企業(yè)申請認定的程序如下：

　　（一）企業(yè)自我評價及申請。企業(yè)登錄“高新技術企業(yè)認定管理工作網”，對照辦法第十條規(guī)定條件，進行自我評價。認為符合認定條件的，企業(yè)可向認定機構提出認定申請。

　　（二）提交下列申請材料：

　　1.高新技術企業(yè)認定申請書；

　　2.企業(yè)營業(yè)執(zhí)照副本、稅務登記證（復印件）；

　　3.知識產權證書（獨占許可合同）、生產批文，新產品或新技術證明（查新）材料、產品質量檢驗報告、省級以上科技計劃立項證明，以及其他相關證明材料；

　　4.企業(yè)職工人數、學歷結構以及研發(fā)人員占企業(yè)職工的比例說明；

　　5.經具有資質的中介機構鑒證的企業(yè)近三個會計年度研究開發(fā)費用情況表（實際年限不足三年的按實際經營年限），并附研究開發(fā)活動說明材料；

　　6.經具有資質的中介機構鑒證的企業(yè)近三個會計年度的財務報表（含資產負債表、損益表、現金流量表，實際年限不足三年的按實際經營年限）以及技術性收入的情況表。